Sur le bassin de la Boutonne, dans le cadre du nouveau SAGE révisé en 2016, 5 enjeux ont été identifiés et déclinés dans le projet d'aménagement et de gestion des eaux, le projet de territoire Boutonne
1 : Etat quantitatif des masses d’eau superficielles et souterraines
2 : Gestion des crues et du risque inondation
3 : Approche intégrée de la gestion de la ressource en eau et des politiques d’aménagement des territoires
4 : Etat qualitatif des masses d’eau superficielles et souterraines
5 : Fonctionnalités des cours d’eau et des milieux associés
Le schéma ci-dessous en résume les problématiques et leurs inter-dépendances :