Enjeu n°4 du SAGE Boutonne révisé, la reconquête de la qualité de l'eau concerne les problématiques : une pollution généralisée par les nutriments (nitrates, phosphore), en lien avec une généralisation des grandes cultures et l'utilisation d'intrants agrochimiques et laissant peu de place aux zones « tampons » (boisements, zones humides...), la dégradation de la qualité des masses d’eau superficielles impacte la ressource souterraine y compris par les substances phytosanitaires en nappes profondes...

Enjeu n°3 du SAGE Boutonne révisé, la gestion quantitative concerne les problématiques : étiage, ressource superficielle et souterraine, l'amélioration nécessaire de la métrologie, la maîtrise des prélèvements agricoles et la sécurisation de l'AEP, la protection contre les crues.

Enjeu n°2 du SAGE Boutonne révisé, la restauration des fonctionnalités et de la biodiversité des milieux aquatiques s'inscrit pleinement dans la compétence GEMAPI.